完整密码子适应指数
从完整 DNA CDS 和明确的参考或权重计算 CAI，保留全部基因状态、64 项权重、原始字节与密码子位置。
浏览器本地处理输入UTF-8 FASTA / codon,weight CSV输出JSON / CSV / 原始字节
开始之前
从完整 DNA CDS 和明确的参考或权重计算 CAI，保留全部基因状态、64 项权重、原始字节与密码子位置。
如何使用
- 声明模式、密码表和正向阅读框，提供完整活跃来源。
- 运行后逐条查看基因状态、64 项权重及原始位置。
- 复制完整 JSON，下载全部来源、设置、CSV 和 NOTICE。
支持范围与限制
联合限制：输入 64 MiB；基因与参考各 10,000 条；1,000 万碱基；400 万密码子；64 项明确权重；4,000 万数值工作单位。同时受表示与内存限制。
所有物理文件合计 256 MiB；完整文本和复制各 256 MiB；完整转义 typed JSON 512 MiB；合计 1,280 MiB；wire 4 GiB；owned 1,536 MiB；同一个 180 秒时限。各上限并非同时可达容量证明。
每个活跃角色仅允许一个完整粘贴来源或一个本地文件。无歧义 ACGT；ID 在同一角色中唯一；不裁切尾部、推断物种或补造 STOP 权重。
字面移植 Biopython 1.85 CAI 方法；保留全部 27 张 DNA 表和原始 Biopython 1.81 旧权重。NOTICE.txt 包含完整双许可证。
操作示例
示例输入
>gene1 ATGGCCGCTTAA >gene2 ATGTGG
示例参数
reference / table 1 / frame 0
示例输出
gene2：未定义，分母 0；保留全部原始位置。
出现问题时
修正完整输入或选项后重新运行。每次运行创建新的工作线程，已选文件可再次使用。
常见问题
STOP 是否全部排除？
按上游实现计入已索引的 STOP。仅缺失的字面 TAA/TAG/TGA 被跳过。ATG/TGG 在所有密码表下均按字面排除。
没有参与密码子的基因如何显示？
保留整条记录和位置；CAI 与 log CAI 为 null，分母为 0，并给出警告。其他致命失败不产生成功的部分导出。