BED 逐样本重叠计数矩阵

如何使用

1. 先选择参考文件，再选择全部样本文件。
2. 向上或向下移动样本，确认矩阵计数列的顺序。
3. 运行并核对参考/样本记录数与所有下载字节数。
4. 完整复制矩阵，或下载矩阵、报告与全部源副本；在分析流程中核对基因组坐标版本一致。

支持范围与限制

明确选择 1 份参考 BED 和按输出列顺序排列的 1–20 份样本 BED。全部原始文件合计最多 4 MiB、100,000 条区间记录。物理空文件拒绝；含空白或注释的非空样本输出零计数；参考文件必须包含区间。

每条记录为 3–12 个非空字段，以 ASCII 空格或 TAB 分隔；前三列为染色体、起点、终点，其余字段按不透明文本完整保留。矩阵会规范行首尾 ASCII 分隔符。引号和反斜杠是字面字符；不支持空字段或含内部空白的字段。

染色体和源名称最多 512 UTF-8 字节；每个坐标或额外字段最多 65,536 UTF-8 字节。名称须为无 C0/C1/DEL/BOM 控制字符的标量 Unicode。操作系统或文件选择器可能设置更短的文件名上限。

坐标只接受 ASCII 十进制整数，满足 0 ≤ start < end ≤ 9007199254740991。拒绝正负号、小数、指数和零宽区间；保留坐标的前导零拼写。染色体标识区分大小写，输入不要求排序。

区间为从零开始的半开区间 [start,end)，相邻端点不算重叠。每条重复或嵌套样本记录分别计入；参考记录不去重、不排序；末尾计数列严格对应屏幕上的样本顺序。

严格 UTF-8，可含一个开头 BOM；允许 LF、CRLF 或混合换行。拒绝单独 CR、错误编码、C0/C1/DEL 控制字符和非开头 BOM。空行、ASCII 空白行及从第零列 # 开始的注释不参与计数，但原始下载完整保留。

全部下载合计最多 32 MiB，包含 overlap-matrix.bed、完整 result-report.json 和所有原始源副本。在分配完整计数矩阵、输出文本和序列化报告前核算精确大小；超限时不提供部分矩阵、复制内容或下载。

矩阵使用 TAB/LF、无表头，保留每个参考字段，再追加每份样本的整数计数。完整报告保留每个字段与计数、源名称/SHA256/字节数/BOM/换行/物理行数、样本记录数和完整导出元数据。源副本保留所有原始字节。

处理在本地 Worker 中进行；10 秒总期限覆盖加载、读取、就绪和计算。取消或超时会终止 Worker，可以用同一批已选文件和顺序重试。屏幕最多预览 4,000 个 Unicode 码点，复制和下载始终完整。

按完整坐标跨度计数，不验证 BED 注释语义，不展开 block，不做链方向或重叠比例筛选，也不推断基因组版本。追加计数列可能超过 12 列，其含义是样本计数而非 BED12 注释。文件内容和名称不上传。